Diferentemente da primeira edição, realizada em 2024, esta nova fase do CNU reúne outros órgãos públicos, com o objetivo de promover seleções centralizadas e mais acessíveis. A distribuição das vagas por carreira e instituição foi definida pelo Ministério da Gestão e da Inovação em Serviços Públicos (MGI).
- Agência Nacional de Aviação Civil (Anac)
- Agência Nacional do Cinema (Ancine)
- Agência Nacional de Mineração
- Agência Nacional do Petróleo, Gás Natural e Biocombustíveis (ANP)
- Agência Nacional de Saúde Suplementar
- Agência Nacional de Telecomunicações (Anatel)
- Agência Nacional de Transportes Aquaviários (Antaq)
- Agência Nacional de Transportes Terrestres (ANTT)
- Agência Nacional de Vigilância Sanitária (Anvisa)
- Centro Nacional de Primatas (CENP) do Ministério da Saúde
- Comando da Aeronáutica
- Comando do Exército Brasileiro
- Comando da Marinha do Brasil
- Escola Nacional de Administração Pública (Enap)
- Fundação Biblioteca Nacional (FBN)
- Fundação Cultural Palmares (FCP)
- Fundação Joaquim Nabuco (Fundaj)
- Fundação Jorge Duprat Figueiredo de Segurança e Medicina do Trabalho (Fundacentro)
- Fundação Nacional das Artes (Funarte)
- Hospital das Forças Armadas (HFA)
- Imprensa Nacional
- Instituto Brasileiro de Museus (Ibram)
- Instituto Evandro Chagas (IEC) do Ministério da Saúde
- Instituto Nacional de Tecnologia da Informação
- Instituto Nacional de Câncer (Inca) do Ministério da Saúde
- Instituto Nacional de Cardiologia (INC) do Ministério da Saúde
- Instituto Nacional de Traumatologia e Ortopedia (INTO) do Ministério da Saúde
- Instituto do Patrimônio Histórico e Artístico Nacional (Iphan)
- Ministério das Cidades
- Ministério do Desenvolvimento Agrário e Agricultura Familiar
- Ministério da Fazenda
- Ministério da Gestão e da Inovação em Serviços Públicos
- Ministério da Integração e do Desenvolvimento Regional
- Ministério da Pesca e Aquicultura (MPA)
- Ministério do Turismo
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